三疣梭子蟹（Portunus trituberculatus）肥满度性状全基因组关联分析及候选基因挖掘

学术精汇

作者：

黄煜超1 2 初凡智1 苏轶辰1 2 高保全1 3 王学忠4 吕建建*1 3

作者单位：

1. 海水养殖生物育种与可持续产出全国重点实验室(中国水产科学研究院黄海水产研究所)2. 水产科学国家级实验教学示范中心(上海海洋大学)3. 崂山实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室4. 昌邑市海丰水产养殖有限责任公司

摘要：

三疣梭子蟹（Portunus trituberculatus）是我国主要的海水养殖蟹类，具有重要的经济价值。肥满度性状是蟹类重要的品质性状，其调控机制尚不明确。测定了同一养殖环境下的298只三疣梭子蟹全甲宽和体重，计算得肥满度范围0.66～1.47，符合正态分布；利用全基因组测序（WGS）技术进行个体基因分型，估计肥满度性状遗传力为0.391±0.158。基于混合线性模型进行全基因组关联分析（GWAS），挖掘到99个与肥满度性状显著相关的SNP位点，主要分布于10号、26号和41号染色体。单倍型分析结果显示，10号染色体上存在2个强连锁的单倍型，分别包含6个和7个SNP位点，并成功验证了这13个SNP位点的可靠性。进一步分析了单倍型以及CDS区域的基因，共挖掘到lman1、adcy3和cdc6等15个可能与肥满度性状相关的候选基因。研究结果为解析三疣梭子蟹肥满度调控分子机制及良种培育提供了数据支撑。

关键词：

三疣梭子蟹肥满度遗传力全基因组关联分析候选基因

刊期：

2025，4（56）

所属栏目：

水产和渔业学

基金资助：

山东省重点研发计划资助(2024LZGC023号),中国水产科学研究院中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金资助(2023XT0204号,2023TD50号),海水养殖生物育种与可持续产出全国重点实验室开放课题(BRESG202306号),国家虾蟹产业技术体系(CARS-48号)

分类号：

S917

DOI：

10.11693/hyhz20250200031

页数：

页码：

1012-1020

来源期刊

海洋与湖沼

Oceanologia et Limnologia Sinica